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Spots labeln

Labels können für jeden Spot und an jeder beliebigen x-y-Koordinate auf einem Bild eingefügt werden. So können Sie z.B. interessante Spots für Spotpicker kennzeichnen oder Proteinnamen und andere Annotationen anhängen. Über den Labelnamen und/oder dessen Farbe können zusätzliche Information, wie der vorhergesagte isoelektrische Punkt oder die molekulare Masse angegeben werden.

Dual View mit aktiviertem Label Tool

Um Spots zu labeln und/oder Labels zu bearbeiten, selektieren Sie bitte das 'Label Tool': Klicken Sie auf den letzten Button in dem linken vertikalen Tool-Panel der Dual View.

Label erstellen

Klicken Sie mit dem selektierten 'Label Tool' irgendwo auf das Bild: Ein Pfeil wird zusammen mit einem Textfeld erzeugt, in dem 'Click here to edit ...' steht. Klicken Sie in dieses Feld, um dem Label den gewünschten Namen zu geben. Falls Sie den Text nachträglich ändern wollen, klicken Sie einfach erneut mit der linken Maustaste auf ihn.

Neue Label werden in der Dual View standardmäßig auf dem blauen Bild erzeugt - in unserem Beispiel: 'control_01'. Um ein Label auf dem anderen Bild zu erstellen, halten Sie einfach die SHIFT Taste auf der Tastatur gedrückt, während Sie mit dem Label Tool an die gewünschte Stelle klicken. Um Label direkt auf die zugehörigen Bilder zu setzen, können Sie natürlich auch auf die Einzelansicht des jeweiligen Bildes wechseln (Tab am unteren Bildrand).

Um das Label an eine andere Position zu verschieben, ziehen Sie mit der linken Maustaste an der Pfeilspitze. Wenn kaum noch Platz zum Beschriften übriggeblieben ist, ziehen Sie am Text, um nur diesen (ohne veränderte Position der Pfeilspitze) an einer neuen Position zu plazieren. Sobald eine Labelspitze in einen Spotumriss zeigt, wird das Label diesem Spot zugewiesen und erscheint in dessen Zeile in der Quantitation Table in der Labelspalte. Auch dort können Sie Labels editieren oder erstellen, indem Sie in der entsprechenden Zelle der Tabelle mit der linken Maustaste doppelt klicken. Mit Hilfe des 'Labels' Menü in der Dual View ist es zudem möglich, gleichzeitig für mehrere selektierte Spots Labels zu erzeugen.

Labels auf andere Bilder übertragen

Nachdem das Warping fertiggestellt wurde, kennt Delta2D alle Laufunterschiede zwischen den Gelen eines Projektes. Dies kann genutzt werden, um zuverlässig Label von einem Gelbild auf ein anderes zu übertragen.
Beispielsweise können alle Proteinnamen als Label auf der Proteomkarte - idealerweise ist dies ein Fusionsbild des Typs 'Union' - gespeichert werden. Diese Label können über die Dual View auf andere Bilder übertragen werden: Klicken Sie mit der rechten Maustaste auf ein Label und wählen Sie 'copy' oder 'move' aus dem Kontextmenü. Um alle Labels gleichzeitig zu übertragen, wählen Sie 'Labels' -> 'Copy' bzw. 'Labels' -> 'Move'. Für weitere Informationen zum Thema Labels ziehen Sie bitte das Delta2D Manual zu Rate.