Ergebnisse exportieren und präsentieren
Rohdaten und Auswertungsergebnisse können aus Delta2D in verschiedensten Formaten exportiert werden:
- Tabellen können als CSV Dateien oder direkt als Tabelle oder Report nach Microsoft Excel (wenn auf Ihrem Computer vorhanden) exportiert werden.
- Bildansichten können Sie als Standardbildformate oder direkt nach Microsoft Powerpoint (wenn auf Ihrem Computer vorhanden) exportieren.
- Interaktive Reports können in Form von HTML Datei(en) erstellt werden.
- Picklisten können für eine Vielzahl von Spotpickern im entsprechenden Format exportiert oder direkt in die Bruker Proteineer Datenbank übertragen werden.
Reports und Picklisten beinhalten nur Daten von Spots, die 'markiert' wurden. Sie können Spots entweder in der Quantitation Table markieren,
indem Sie diese selektieren und 'Mark' -> 'Mark selected spots' wählen, oder aber indem Sie in der Dual View mit der rechten Maustaste auf den Spot klicken
und aus dem Kontextmenü 'Mark Spot' auswählen.
Tabellen nach Excel exportieren
Beim Export von Tabellen aus Delta2D wird immer genau das exportiert, was Sie sehen - d.h. nur sichtbare Spalten mit sichtbaren Expressionsprofilen.
Dadurch können Sie die Filter der Tabellen verwenden, um uninteressante Daten vom Export auszuschließen.
Öffnen Sie die Quantitation Table über das 'Window' Menü. Falls gewünscht, können Sie Filter - wie unter 'Quantitative Auswertung der Gelbilder' beschrieben - aktivieren.
Wählen Sie nun aus dem Tabellenmenü 'File' -> 'Export to Excel' aus. Nun öffnet sich eine Excel Arbeitsmappe, die Ihre Daten enthält.
Bitte beachten Sie, dass für diese Aktion in Excel Makros aktiviert sein müssen.
Exportieren von Bildansichten nach Powerpoint
Das Erstellen von Microsoft Powerpoint Präsentationsfolien erzielen Sie mit Delta2D über ein paar Klicks:
Öffnen Sie die Dual View für ein Bildpaar, wählen Sie das gesamte Bild oder einen interessanten Bildausschnitt (zoomen Sie entsprechend in das Bild)
und steuern Sie die Sichtbarkeit von Objekten wie Match-Vektoren, Spotumrissen und Labeln über das Rollup 'Overlays'.
Wählen Sie nun 'File' -> 'Export to Powerpoint', aktivieren Sie beide Kästchen im folgenden Dialog und bestätigen Sie mit OK.
(Bitte achten Sie darauf, dass in Powerpoint Makros aktiviert sind.) Folgen Sie nun den Anweisungen auf dem Bildschirm.
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Ein typischer Powerpoint Export:
Jedes Objekt kann über die Powerpoint Eigenschafts- und Formatdialoge angepasst werden.
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Jedes in der Dual View sichtbare Objekt kann in der nun erzeugten Powerpoint-Folie wie ein Powerpoint Objekt angepasst werden.
So können Sie beispielsweise unwichtige Spotumrisse löschen, bestimmte Label besonders hervorheben, Spots und andere Objekte farblich verändern sowie
Schriftgröße und -farbe anpassen - bis die Präsentation Ihren Vorstellungen entspricht.
Interaktive HTML-Berichte erstellen
Typischerweise sollen die Ergebnisse eines Experiments an Kollegen weitergegeben, auf einer Website oder in einem wissenschaftlichen Artikel veröffentlicht werden.
Um die Extraktion der relevanten Informationen zu vereinfachen, werden in Delta2D auch interaktive HTML Berichte verwendet.
Wählen Sie im Project Manager 'Reports' und selektieren Sie einen der verfügbaren Reporte. Delta2D enthält die folgenden drei Standard-Report-Typen eingef&uumL;hrt:
- Project Summary
- Spot Album
- Spot Quantities
Der 'Project Summary' Bericht zeigt allgemeine Informationen zum Projekt - wie Angaben zu Proben, Gruppen, Gelen, Gelbildern und zur Warping Strategy - sowie die
entsprechenden Einzelgelbilder und die Dual Channel Bilder. Interaktivität bedeutet hier: ein Linksklick auf ein Dual Channel Bild öffnet die entsprechende
Dual View in Delta2D.
Die Reports können über den 'Save' Button des Reports gespeichert werden.
Nach dem Klick auf den Button nutzen Sie bitte den erscheinenden Delta2D-Dialog zum Abspeichern.
Wenn Sie die Speicherfunktion Ihres Browsers nutzen, wird nur die aktuelle Seite ohne eventuelle Folgeseiten abgespeichert.
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| Spot album report
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Die Berichte 'Spot Album' und 'Spot Quantities' dokumentieren Informationen über Expressionsprofile markierter Spots und ermöglichen einige Anpassungen.
Ein Klick auf das Balkendiagramm oder die Spot-ID selektiert das jeweilige Expressionsprofil in Delta2D und öffnet detailliertere Information zum Spot im 'Spot-Report'.
Picklisten exportieren
Mit Delta2D können Sie Picklisten für eine Vielzahl von Spotpickern exportieren.
Falls Ihr Gerät noch nicht unterstützt wird, können wir dies auf Anfrage gerne implementieren.
Picklisten beinhalten markierte Spots und alle Koordinaten der Spotlabel auf dem jeweiligen Gelbild.
Dadurch können Sie sogar Picklisten für Bilder erstellen, auf denen noch gar keine Spots detektiert wurden:
Labeln Sie einfach die Spots, die Sie interessieren (einfacher möglich nach dem Aktivieren der automatischen Nummerierung für das Labeln),
um deren Koordinaten in die Pickliste aufzunehmen.
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