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Present Results

Rohdaten und Auswertungsergebnisse können aus Delta2D in verschiedensten Formaten exportiert werden:

• Interaktive Reports können in Form von HTML Datei(en) erstellt werden.
• Tabellen können als CSV Dateien oder direkt als Tabelle oder Report nach MS Excel (wenn auf Ihrem Computer vorhanden) exportiert werden.
• Bildansichten können Sie als Standardbildformate oder direkt nach MS Powerpoint (wenn auf Ihrem Computer vorhanden) exportieren.
• Picklisten können für eine Vielzahl von Spotpickern im entsprechenden Format exportiert oder direkt in die Bruker Proteineer Datenbank übertragen werden.

Reports und Picklisten beinhalten nur Daten von Spots, die 'selektiert' oder 'markiert' wurden. Sie können Spots entweder per Klick selektieren oder z.B. in der 'Quantitation Table' markieren, indem Sie die Spots zunächst selektieren und 'Mark' > 'Mark selected spots' wählen, oder aber indem Sie in der 'Dual View' mit der rechten Maustaste auf den Spot klicken und aus dem Kontextmenü 'Mark Spot' auswählen.

Interaktive HTML-Berichte erstellen

Typischerweise sollen die Ergebnisse eines Experiments an Kollegen weitergegeben, auf einer Website oder in einem wissenschaftlichen Artikel veröffentlicht werden. Um die Extraktion der relevanten Informationen zu vereinfachen, werden in Delta2D auch interaktive HTML Berichte verwendet.

Wählen Sie aus dem 'Reports'-Menü einen der folgenden vier Standard-Report-Typen:

Project Summary

Spot Album

Spot Quantities

Labels

Der 'Project Summary' Bericht zeigt allgemeine Informationen zum Projekt - wie Angaben zu Proben, Gruppen, Gelen, Gelbildern und zur Warping Strategy - sowie die entsprechenden Einzelgelbilder und die Dual Channel Bilder. Interaktivität bedeutet hier: ein Linksklick auf ein Dual Channel Bild öffnet die entsprechende Dual View in Delta2D.

Die Reports können über den 'Save' Button des Reports gespeichert werden. Nach dem Klick auf den Button nutzen Sie bitte den erscheinenden Delta2D-Dialog zum Abspeichern. Wenn Sie die Speicherfunktion Ihres Browsers nutzen, wird nur die aktuelle Seite - ohne eventuelle Folgeseiten abgespeichert.

Spot album report

Die Berichte 'Spot Album' und 'Spot Quantities' dokumentieren Informationen über Expressionsprofile selektierter bzw. markierter Spots und ermöglichen einige Anpassungen. Ein Klick auf das Balkendiagramm oder die Spot-ID selektiert das jeweilige Expressionsprofil in Delta2D und öffnet detailliertere Information zum Spot im 'Spot-Report'. Der 'Labels'-Bericht enthält entweder Informationen zu allen Labels eines Bildes oder zu den Labels, die in markierte Spots zeigen.

Tabellen nach MS Excel exportieren

Beim Export von Tabellen aus Delta2D wird immer genau das exportiert, was Sie sehen - d.h. nur sichtbare Spalten mit sichtbaren Expressionsprofilen. Dadurch können Sie die Filter der Tabellen verwenden, um uninteressante Daten vom Export auszuschließen.
Öffnen Sie die 'Quantitation Table'. Falls gewünscht, können Sie Filter - wie oben beschrieben - aktivieren. Wählen Sie nun aus dem Tabellenmenü 'Export' ? 'Export to Excel' aus. Nun öffnet sich eine MS Excel-Arbeitsmappe, die Ihre Daten enthält.

Exportieren von Bildansichten nach MS Powerpoint

Das Erstellen von MS Powerpoint Präsentationsfolien erzielen Sie mit Delta2D über ein paar Klicks: Öffnen Sie die 'Dual View' für ein Bildpaar, wählen Sie das gesamte Bild oder einen interessanten Bildausschnitt (zoomen Sie entsprechend in das Bild) und steuern Sie die Sichtbarkeit von Objekten wie Match-Vektoren, Spotumrissen und Labeln über das Rollup 'Overlays'. Wählen Sie nun 'Export' ? 'Export to Powerpoint', aktivieren Sie beide Kästchen im folgenden Dialog und bestätigen Sie mit OK. Folgen Sie nun den Anweisungen auf dem Bildschirm.

Ein typischer Powerpoint Export: Jedes Objekt kann über die Powerpoint Eigenschafts- und Formatdialoge angepasst werden.

Jedes in der 'Dual View' sichtbare Objekt kann in der nun erzeugten Powerpoint-Folie wie ein Powerpoint Objekt angepasst werden. So können Sie beispielsweise unwichtige Spotumrisse löschen, bestimmte Label besonders hervorheben, Spots und andere Objekte farblich verändern sowie Schriftgröße und -farbe anpassen - bis die Präsentation Ihren Vorstellungen entspricht.

Für den Export nach MS Excel oder MS Powerpoint müssen Makros aktiviert sein. D.h. die Sicherheitsstufe für Makros sollte 'Mittel' oder geringer sein.

Picklisten exportieren

Mit Delta2D können Sie Picklisten für eine Vielzahl von Spotpickern exportieren. Falls Ihr Gerät noch nicht unterstützt wird, können wir dies auf Anfrage gerne implementieren. Picklisten beinhalten markierte Spots und alle Koordinaten der Spotlabel auf dem jeweiligen Gelbild. Dadurch können Sie sogar Picklisten für Bilder erstellen, auf denen noch gar keine Spots detektiert wurden: Labeln Sie einfach die Spots, die Sie interessieren (einfacher möglich nach dem Aktivieren der automatischen Nummerierung für das Labeln), um deren Koordinaten in die Pickliste aufzunehmen.